Un espía infiltrado en la Agencia Nacional de Policía de Japón recupera archivos secretos del MI6 de Gran Bretaña, el BND de Alemania y la CIA y el FBI de Estados Unidos. Mientras tanto, al día siguiente en el acuario de Tokio, Conan y la Liga Juvenil de Detectives encuentran a una mujer con pérdida de memoria, acompañada de un teléfono móvil roto y quien podría estar relacionada con el caso del robo de archivos. Decididos a ayudarla a recuperar su memoria, serán vigilados de cerca por Vermouth, miembro perteneciente a la organización de negro.