Varios meses después del inicio de la guerra entre las colonias espaciales del Ducado de Zeon y la Federación Terrestre y, a pesar de unos combates masivos y ataque orbitales que han diezmado a la humanidad, ningún bando ha conseguido derrotar al otro. Zeon cuenta con la ventaja de sus máquinas humanoides –mobile suits– pero la Federación tiene más recursos y los usa para construir su propio prototipo: el RX-78 Gundam.
Cuando los federales lo trasladan a la colonia neutral de Side 6 para realizar las últimas pruebas, sufre un ataque sorpresa de Zeon. Entre el caos y la confusión, el Gundam y su manual de instrucciones caen en manos del hijo adolescente del creador del MS, Ray Amuro. Este tendrá que ponerse a los mandos y rechazar el ataque para salvar a sus amigos y el resto de la población de Side 6.
